Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad23bP54728 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms