Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf9P54130 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms