Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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