Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux1P53564 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux1P53564 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux1P53564 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux1P53564 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux1P53564 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms