Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RoraP51448 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RoraP51448 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RoraP51448 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RoraP51448 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RoraP51448 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RoraP51448 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RoraP51448 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms