Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx3P50481 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms