Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms