Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms