Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgfaP48030 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms