Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms