Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms