Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox6a1P43024 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms