Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VhlP40338 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VhlP40338 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VhlP40338 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VhlP40338 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VhlP40338 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VhlP40338 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VhlP40338 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VhlP40338 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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VhlP40338 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VhlP40338 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VhlP40338 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VhlP40338 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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