Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms