Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cap1P40124 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cap1P40124 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cap1P40124 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cap1P40124 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cap1P40124 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cap1P40124 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cap1P40124 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cap1P40124 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cap1P40124 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cap1P40124 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cap1P40124 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms