Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf1P39428 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf1P39428 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms