Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprkP35822 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PtprkP35822 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms