Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sftpa1P35242 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sftpa1P35242 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sftpa1P35242 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sftpa1P35242 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sftpa1P35242 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sftpa1P35242 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms