Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa1P35175 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms