Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms