Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dusp1P28563 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms