Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd247P24161 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd247P24161 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms