Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim1P20664 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim1P20664 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms