Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms