Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox5bP19536 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox5bP19536 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox5bP19536 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox5bP19536 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox5bP19536 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox5bP19536 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox5bP19536 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms