Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18532 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18532 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18532 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18532 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18532 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18532 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18532 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18532 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18532 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18532 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18532 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18532 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18532 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18532 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18532 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms