Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf271P15620 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf271P15620 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms