Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms