Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd8bP10300 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd8bP10300 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms