Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01673 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01673 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01673 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01673 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01673 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01673 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01673 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01673 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01673 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01673 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01673 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms