Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Robo1O89026 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Robo1O89026 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms