Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3bO88509 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms