Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme6O88425 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms