Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NlkO54949 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NlkO54949 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NlkO54949 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NlkO54949 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms