Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms