Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1baO35930 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms