Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf9O35739 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms