Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ColqO35348 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ColqO35348 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ColqO35348 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ColqO35348 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ColqO35348 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ColqO35348 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ColqO35348 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ColqO35348 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ColqO35348 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ColqO35348 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ColqO35348 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ColqO35348 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ColqO35348 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ColqO35348 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ColqO35348 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ColqO35348 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ColqO35348 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ColqO35348 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ColqO35348 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ColqO35348 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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ColqO35348 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ColqO35348 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ColqO35348 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms