Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms