Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms