Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Polr1aO35134 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms