Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArxO35085 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArxO35085 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArxO35085 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArxO35085 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArxO35085 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArxO35085 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms