Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncoa3O09000 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncoa3O09000 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncoa3O09000 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncoa3O09000 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncoa3O09000 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms