Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eftud2O08810 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms