Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn1O08788 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms