Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckarO08786 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckarO08786 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CckarO08786 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckarO08786 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms