Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Barx2O08686 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Barx2O08686 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms