Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3488M0QW81 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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