Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3424L7N298 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3424L7N298 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3424L7N298 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3424L7N298 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms