Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms